El Salvador participa oficialmente en 7 áreas temáticas (políticas sociales, salud, diálogo social, institucionalidad, finanzas, justicia y seguridad). Es destacable su participación en el área de finanzas públicas, donde se cuenta además con el doble rol del Ministerio de Hacienda (destinatario y socio operativo). Algunas de las iniciativas que apoya el programa en El Salvador: 

• Puesta en marcha de un Diplomado de Educación Fiscal y Transparencia para docentes de bachilleratos técnicos, a través de una alianza entre el Ministerio de Educación, Hacienda y la Subsecretaría de Transparencia y Anticorrupción.
• La creación de una oficina tributaria móvil. 
• Apoyo directo a la Subsecretaría de Transparencia y Anticorrupción para su fortalecimiento y consolidación institucional para promover la implementación de la LAIP.
• Apoyo a la reestructuración del Consejo Económico y Social.
• El apoyo a la Dirección General de Centros Penales en la creación de un nuevo modelo de gestión productiva y comercial en los centros penitenciarios.